RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560553.1

MFGE8-213, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 4

Gene MFGE8, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.09□□□□□ -1.43
MFGE8-213ENST00000560553 LINC01559Q495D7 138 aa6.09□□□□□ -1.43
MFGE8-213ENST00000560553 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.09□□□□□ -1.43
MFGE8-213ENST00000560553 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.09□□□□□ -1.43
MFGE8-213ENST00000560553 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.09□□□□□ -1.43
MFGE8-213ENST00000560553 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 RHODO00212 210 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 PFDN1O60925 122 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 SEC11BP0C7V7 166 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 GCSHP23434 173 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 XGP55808 180 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 HAMPP81172 84 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 DNLZQ5SXM8 178 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 ZFP82Q8N141 532 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 A0A0D9SG52 128 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 HMSDA8MTL9 139 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 UMAD1C9J7I0 102 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 PRR27Q6MZM9 219 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 SFRP2Q96HF1 295 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.07□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 A0A087WWC5 75 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 EPM2AB3EWF7 344 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 LECT2O14960 151 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 WFDC2Q14508 124 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 LAGE3Q14657 143 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TMUB2Q71RG4 321 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 BAGE2Q86Y30 109 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 Q8N814 137 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 SSTP61278 116 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 ZNF56Q15929 161 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 Q5VSD8 79 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TM2D2Q9BX73 214 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 CCL20P78556 96 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TOR2AQ5JU69 321 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 NIT1Q86X76 327 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 FRZBQ92765 325 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 DERL1Q9BUN8 251 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 MLST8Q9BVC4 326 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 GNG13Q9P2W3 67 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 UBE2D3P61077 147 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 UBE2D2P62837 147 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 BAALCQ8WXS3 180 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 UBE2WQ96B02 151 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 MANBALQ9NQG1 85 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 KLK12Q9UKR0 248 aa6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
MFGE8-213ENST00000560553 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 A0A087WX48 190 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM262E9PQX1 116 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 F5H697 171 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 CXCL1P09341 107 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 GZMBP10144 247 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 CENPWQ5EE01 88 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 C11orf52Q96A22 123 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TPPP3Q9BW30 176 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 RAB19A4D1S5 217 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 SNAI2O43623 268 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 OR5AL1P0C617 328 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 RAB4BP61018 213 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 RMI2Q96E14 147 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.01□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-213ENST00000560553 TEX46H3BTG2 121 aa6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms