RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560549.5

TMOD3-207, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMOD3, Length 1,474 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-207ENST00000560549 APCSP02743 223 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 TRGV3P03979 118 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 SLC25A16P16260 332 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 Q0VG73 95 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 IQCJQ1A5X6 159 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.22□□□□□ -1.89
TMOD3-207ENST00000560549 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.22□□□□□ -1.89
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TMOD3-207ENST00000560549 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.96e-7■■■□□ 15.2
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TMOD3-207ENST00000560549 CSN1S1P47710 185 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-207ENST00000560549 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.19□□□□□ -1.9
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TMOD3-207ENST00000560549 H3BUA1 57 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 J3QLI3 93 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 M0QZK8 103 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 NDUFA4O00483 81 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF138P52744 262 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 HBBP68871 147 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 TAL2Q16559 108 aa3.18□□□□□ -1.9
TMOD3-207ENST00000560549 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.18□□□□□ -1.9
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TMOD3-207ENST00000560549 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.18□□□□□ -1.9
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