RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PRE2 83 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 IFNA7P01567 189 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 SERF2P84101 59 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 M0R036 132 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 IGLV2-8P01709 118 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TMEM262E9PQX1 116 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 DEFA1P59665 94 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 DEFA3P59666 94 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 Q0VG73 95 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 C14orf177Q52M58 125 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 SFRP2Q96HF1 295 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 PEX7O00628 323 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 CRIP1P50238 77 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 UBE2G2P60604 165 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 DNLZQ5SXM8 178 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 Q86TA4 180 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 M0R381 172 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 SH2D1AO60880 128 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 AQP10Q96PS8 301 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-214ENST00000548849 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 CRPP02741 224 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 UBE2D3P61077 147 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 UBE2D2P62837 147 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 FAM162BQ5T6X4 162 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ENHOQ6UWT2 76 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ZNF726P1Q15940 193 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ZFP82Q8N141 532 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ALG5Q9Y673 324 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 FAM74A7A6NL05 159 aa11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 HLA-DQA1P01909 254 aa11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 UBE2G1P62253 170 aa11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 USP17L23D6RBM5 183 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 LINC01559Q495D7 138 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 MPV17L2Q567V2 206 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 FMC1Q96HJ9 113 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 ZNF56Q15929 161 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 PTTG1O95997 202 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 PRSS1P07477 247 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 RAB4BP61018 213 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 Q5BKY6 102 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 MED28Q9H204 178 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-214ENST00000548849 MIAQ16674 131 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 A6NHS1 94 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 LTAP01374 205 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 PKIAP61925 76 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 CST9LP1Q5W188 147 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 PRR27Q6MZM9 219 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 F5H697 171 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 AKR1C3P42330 323 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 PANO1I0J062 215 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 GAGE6Q13070 117 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 928.2 ms