RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00869P0C866 280 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 PRAC2D3DTV9 90 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 SYNGR2O43760 224 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF253O75346 499 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 EVI2AP22794 236 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 LCN15Q6UWW0 184 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-205ENST00000547715 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 H3BP45 60 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PSCAO43653 123 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CST7O76096 145 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-53P01767 116 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CTRLP40313 264 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 RASL11AQ6T310 242 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 S100A7AQ86SG5 101 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PRO0255Q9UI72 69 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 MPDU1O75352 247 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 IGLC2P0DOY2 106 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 IGLC3P0DOY3 106 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 LEPP41159 167 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PLP1P60201 277 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 BAGE3Q86Y29 109 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 BAGE2Q86Y30 109 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PSENENQ9NZ42 101 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 DIRC3C9JPN6 131 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 H3BTX0 84 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CT45A10P0DMU9 189 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CST9LP1Q5W188 147 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PATE2Q6UY27 113 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 Q6ZN92 141 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 C8orf49Q96NF6 230 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 IL36BQ9NZH7 164 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 RNF24Q9Y225 148 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 C9JCJ5 164 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SLC17A3O00476 420 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SPINK4O60575 86 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 GPX1P07203 203 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CRYGDP07320 174 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SCGB1A1P11684 91 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CRYBA4P53673 196 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF726P1Q15940 193 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SPATA45Q537H7 98 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 TEPPQ6URK8 271 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SFRP2Q96HF1 295 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 CCL25O15444 150 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 OR10J4P0C629 311 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SLAQ13239 276 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 BATFQ16520 125 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 Q8N814 137 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 BORCS7Q96B45 105 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 ODF3Q96PU9 254 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 VPS25Q9BRG1 176 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 HLA-DQA1P01909 254 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SRIP30626 198 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 TCL1AP56279 114 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 VWC2Q2TAL6 325 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 KCNS1Q96KK3 526 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRB-205ENST00000547715 C7orf71A4D174 169 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 FHL2Q14192 279 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 VGLL1Q99990 258 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRB-205ENST00000547715 ST20Q9HBF5 79 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms