RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 RHODO00212 210 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 NDUFB6O95139 128 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 S100A5P33763 92 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SPCS2Q15005 226 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 MIAQ16674 131 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 KHDC3LQ587J8 217 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 WDR73Q6P4I2 378 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 FXYD5Q96DB9 178 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 LINC00479Q96M42 142 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 PARLQ9H300 379 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 OTORQ9NRC9 128 aa5.07□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 A0A0J9YXV3 536 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 PRSS1P07477 247 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TRIQKQ629K1 86 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 MITD1Q8WV92 249 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 GTSF1Q8WW33 167 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TRIM63Q969Q1 353 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.06□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 A0A087WYN8 130 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 PHOX2AO14813 284 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SMUG1Q53HV7 270 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 THAP6Q8TBB0 222 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 C9orf85Q96MD7 179 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 MBD2Q9UBB5 411 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 hDV102S1A0JD36 115 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 CCSO14618 274 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 GCGP01275 180 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 LINC00694P0DN24 101 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 ENHOQ6UWT2 76 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.04□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 A0A1W2PPV4 95 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 IGSF23A1L1A6 192 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TMBIM6P55061 237 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 RNF213Q63HN8 5207 aa5.03□□□□□ -1.6
CLPB-211ENST00000542555 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 A0A087WWL8 130 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PANO1I0J062 215 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 IFNA7P01567 189 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.02□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 FAM231BA6NCW3 169 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PTTG1O95997 202 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 TCRBP04435 133 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP10-8P60410 259 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 RAB32Q13637 225 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 MAJINQ3KP22 176 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 CFAP161Q6P656 301 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PRNTQ86SH4 94 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 TVP23CQ96ET8 276 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 SGK494Q96LW2 274 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 IL36BQ9NZH7 164 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PSG8Q9UQ74 426 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.01□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 LRP2P98164 4655 aa5□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 H3BMQ9 156 aa5□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 CHTF8P0CG12 524 aa5□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 GZMBP10144 247 aa5□□□□□ -1.61
CLPB-211ENST00000542555 UBE2D3P61077 147 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms