RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531895.5

ANKRD42-208, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-208ENST00000531895 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.32□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 HIVEP2P31629 2446 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.3□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 CBY3A6NI87 242 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 HTN1P15515 57 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 LAGE3Q14657 143 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 JMJD8Q96S16 334 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 C20orf78Q9BR46 151 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 C20orf202A1L168 122 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 SAP30O75446 220 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 IGLV1-51P01701 117 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 SMIM17P0DL12 118 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 DKK2Q9UBU2 259 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF876PQ49A33 203 aa11.27□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.27□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.27□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.27□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 CSTL1Q9H114 145 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 XCL2Q9UBD3 114 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 OR11H12B2RN74 326 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 M0QY20 66 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 SYT8Q8NBV8 401 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 F5H697 171 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 AZU1P20160 251 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ODF1Q14990 250 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 Q6ZN92 141 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ST20Q9HBF5 79 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 NOTCH2Q04721 2471 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 STHQ8IWL8 128 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 LINC01587Q99440 93 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.24□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 NUDT3O95989 172 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 STPG4Q8N801 248 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ZMAT4Q9H898 229 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 HIVEP1P15822 2718 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 M0R143 59 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 INSP01308 110 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 TOMM6Q96B49 74 aa11.23□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.22□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 A0A1B0GV90 55 aa11.22□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 CRLF1O75462 422 aa11.22□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF56Q15929 161 aa11.22□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 PPP1R17O96001 155 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 FOSL1P15407 271 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 Q6ZSN1 163 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 Q9UF83 564 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 NACAE9PAV3 2078 aa11.21□□□□□ -0.61
ANKRD42-208ENST00000531895 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.21□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 PRSS1P07477 247 aa11.21□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 TCTAP57738 103 aa11.21□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.21□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 M0R2P5 195 aa11.2□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 P0DMU3 169 aa11.2□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM231AP0DMU4 169 aa11.2□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM231CP0DMU5 169 aa11.2□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.2□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 K7EMI3 77 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 ATP5LO75964 103 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF415Q09FC8 603 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 PTH2Q96A98 100 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 FGF6P10767 208 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 IL17DQ8TAD2 202 aa11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ANKRD42-208ENST00000531895 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms