RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 TMBIM6P55061 237 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK5R1Q15078 307 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB110Q30KQ9 67 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 IFT20Q8IY31 132 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX47Q8TBZ9 253 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 REG4Q9BYZ8 158 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 ODAMA1E959 279 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 PIRTP0C851 137 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 KDELR1P24390 212 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CARD19Q96LW7 228 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PRE2 83 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 SARNPP82979 210 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 MSMO1Q15800 293 aa2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 APOC2P02655 101 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB4BP61018 213 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RTL8BQ17RB0 113 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf22Q6V702 233 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMF1Q92530 271 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 SORL1Q92673 2214 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 H0YGG7 62 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 PATE2Q6UY27 113 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 MED12LQ86YW9 2145 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CCL19Q99731 98 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 ROMO1P60602 79 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TFF3Q07654 80 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CROCCP2Q86T23 111 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX29Q8N6K0 151 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF714Q96N38 554 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 MED9Q9NWA0 146 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF11Q9Y3C5 154 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PFDN1O60925 122 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 DHFRP00374 187 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 MPC1LP0DKB6 136 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PSPHP78330 225 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 MORN4Q8NDC4 146 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 SMR3AQ99954 134 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 AIF1LQ9BQI0 150 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC32Q9BV29 185 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 FAIMQ9NVQ4 179 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 ASB4Q9Y574 426 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.89□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 K7ERJ3 54 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4K15Q8NH41 348 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 OTORQ9NRC9 128 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CACNA1CQ13936 2221 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 ZANQ9Y493 2812 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 B4DSR2 109 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 GRPEL2Q8TAA5 225 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 BORCS8Q96FH0 119 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFAF1Q9Y375 327 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 STATHP02808 62 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 CRYGSP22914 178 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf137Q5JT78 98 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR15Q8IV56 129 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 EFCAB11Q9BUY7 163 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 AKAP6Q13023 2319 aa2.86□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PGGT1B-205ENST00000514178 VWFP04275 2813 aa2.85□□□□□ -1.95
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