RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF415Q09FC8 603 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 GATD1Q8NB37 220 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 C9orf85Q96MD7 179 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.6□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 SNURFLB1AK76 121 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 ZFP82Q8N141 532 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.59□□□□□ -0.87
FOXD1-201ENST00000513595 NXPH4O95158 308 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 NTF3P20783 257 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 CAMPP49913 170 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 RAB4BP61018 213 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TWIST1Q15672 202 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SYT8Q8NBV8 401 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 PTH2Q96A98 100 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SPXQ9BT56 116 aa9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TRGC1P0CF51 173 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 HTN1P15515 57 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 C16orf74Q96GX8 76 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 MDFICQ9P1T7 246 aa9.57□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 HSPG2P98160 4391 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TRGC2P03986 189 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 RRN3P1Q2M238 152 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 Q6ZWC4 215 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 FRZBQ92765 325 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.56□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 M0R2P5 195 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 M0R381 172 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 APCSP02743 223 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 RAB5BP61020 215 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 AP1S3Q96PC3 154 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.54□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.54□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 DNAH2Q9P225 4427 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 PHOX2AO14813 284 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 AZU1P20160 251 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SSTP61278 116 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.53□□□□□ -0.88
FOXD1-201ENST00000513595 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 SLAQ13239 276 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 DEFB135Q30KP9 77 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF876PQ49A33 203 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RNF183Q96D59 192 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.52□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 SPRY2O43597 315 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 PRM2P04554 102 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 SMIM17P0DL12 118 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 EVI2AP22794 236 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RETNQ9HD89 108 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 X6R8D5 127 aa9.51□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 A8MWV9 139 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 PPBPP02775 128 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 MIFP14174 115 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 AMN1Q8IY45 258 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 OR11H2Q8NH07 326 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RASL10AQ92737 203 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 EREGO14944 169 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RAB4AP20338 218 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 MRAP2Q96G30 205 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RNF185Q96GF1 192 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 RHODO00212 210 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BKO60814 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BJP06899 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BOP23527 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BBP33778 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BDP58876 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BCP62807 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 ORMDL3Q8N138 153 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.48□□□□□ -0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms