RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 PRNTQ86SH4 94 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF491Q8N8L2 437 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 MED12Q93074 2177 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 E7EQL1 145 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 A0A096LPE4 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PPZ6 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 NNATQ16517 81 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 RMI2Q96E14 147 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CTSZQ9UBR2 303 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP54Q96N23 3096 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-216ENST00000507116 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV4-34P06331 123 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 RNF185Q96GF1 192 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 UNC13CQ8NB66 2214 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1BQ00975 2339 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 A0A087WZ39 114 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 MIFP14174 115 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 NACAE9PAV3 2078 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1EQ15878 2313 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TOMM6Q96B49 74 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SNURFQ9Y675 71 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 ACACBO00763 2458 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 M0R1W7 72 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 M0R381 172 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00846Q9NV44 126 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 C11orf86A6NJI1 115 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CCL17Q92583 94 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 AMELXQ99217 191 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0J9YX75 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 COX7A2LO14548 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV12-3P01733 135 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 C2orf83Q53S99 150 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TRANK1O15050 2925 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 KNTC1P50748 2209 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV2-11P01706 119 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 REV3LO60673 3130 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 Q0VFX4 171 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZS52 159 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 Q8IYB0 196 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 H0Y8X5 98 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00205P59089 165 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 DIRC1Q969H9 104 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 MDFIQ99750 246 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGIPA6NJ69 53 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 LEPROTO15243 131 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 FSTL3O95633 263 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CD28P10747 220 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2AP49459 152 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 URB1O60287 2271 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 PATE2Q6UY27 113 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CNFNQ9BYD5 112 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SPTA1P02549 2419 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 GAS8-AS1O95177 125 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CRIP1P50238 77 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 SYCNQ0VAF6 134 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 LPAL2Q16609 132 aa4.53□□□□□ -1.68
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