RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	PTTG1	O95997	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ASIP	P42127	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2G2	P60604	165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	LELP1	Q5T871	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	SUN5	Q8TC36	379 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	PTH2	Q96A98	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GGTLC3	B5MD39	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV2-11	P01706	119 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	XG	P55808	180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP10-1	P60331	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2G1	P62253	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE1	Q13065	139 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE4	Q13068	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE5	Q13069	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		A0A087WWC5	75 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		B4DEV8	164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		Q5BKY6	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		Q5VSD8	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	STOML3	Q8TAV4	291 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	HSPG2	P98160	4391 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		M0R036	132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	PEX7	O00628	323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	SEC11B	P0C7V7	166 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	LAGE3	Q14657	143 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	CST9LP1	Q5W188	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	FMC1	Q96HJ9	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	PARL	Q9H300	379 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	RNF222	A6NCQ9	220 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	FAM74A7	A6NL05	159 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		H3BVH4	76 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	RHOD	O00212	210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF726P1	Q15940	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N814	137 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	RMI2	Q96E14	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	JPT2	Q9H910	190 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-238	ENST00000493853		A0A087WX48	190 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		M0R381	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ARPC5	O15511	151 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SH2D1A	O60880	128 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	AKR1C3	P42330	323 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ELOB	Q15370	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853		Q86TA4	180 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	LECT2	O14960	151 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	FHIT	P49789	147 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	CRIP1	P50238	77 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	HAMP	P81172	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	RGS21	Q2M5E4	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	ZFP82	Q8N141	532 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RBM39-238	ENST00000493853	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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