RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493594.6

GBP3-208, Transcript of guanylate binding protein 3, human

TSL 1 (best)

Gene GBP3, Length 2,561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GBP3-208	ENST00000493594	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	AMELX	Q99217	191 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	C3orf56	Q8N813	242 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594		Q8N6K4	173 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ODF3	Q96PU9	254 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	LINC01620	Q4KN68	170 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
GBP3-208	ENST00000493594	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PRSS2	P07478	247 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	CFAP161	Q6P656	301 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	LINC00477	Q96M19	166 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PRO3102	Q9H379	93 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	AKAP6	Q13023	2319 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	VCY	O14598	125 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PPP1R17	O96001	155 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	LINC00315	P59091	139 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	SPTA1	P02549	2419 aa		6.27	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	NPC2	P61916	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		Q6ZSV7	163 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TMEM141	Q96I45	108 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	DUX3	Q96PT4	197 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		H3BMM0	161 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		M0R1W7	72 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRIAP1	O43715	76 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	ZNF56	Q15929	161 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	SPX	Q9BT56	116 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	COL12A1	Q99715	3063 aa		6.26	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		P0DMU3	169 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	FAM231A	P0DMU4	169 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	FAM231C	P0DMU5	169 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	EBI3	Q14213	229 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TIMM17A	Q99595	171 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		U3KQE9	123 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		A0A0B4J2C4	111 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		A0A0J9YXV3	536 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TMEM223	A0PJW6	202 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRBV12-3	P01733	135 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TTC28	Q96AY4	2481 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		A0A087WW49	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	LEPROT	O15243	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	UBE2E1	P51965	193 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	FOXC1	Q12948	553 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PIP4P1	Q86T03	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		H7C423	109 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		M0QXV9	152 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	LGALS9	O00182	355 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	OVOL1	O14753	267 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TMEM219	Q86XT9	240 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		A0A0J9YXY3	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594		Q6Q795	121 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GBP3-208	ENST00000493594	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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