RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP9Q99996 3911 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GV72 72 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 K7ERJ3 54 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV1-51P01701 117 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ATMQ13315 3056 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 MCM3APO60318 1980 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1EQ15878 2313 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 TEN1Q86WV5 123 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ISOC1Q96CN7 298 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM14CQ9P0S9 112 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 APC2O95996 2303 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK2Q92608 1830 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CCL25O15444 150 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 LYRM1O43325 122 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 NUPR1O60356 82 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 DNAL4O96015 105 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 PRR15Q8IV56 129 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AS1Q8N127 324 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 BORCS8Q96FH0 119 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 MYO7AQ13402 2215 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC18Q8N456 261 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 SMPXQ9UHP9 88 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 RNF11Q9Y3C5 154 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ASB4Q9Y574 426 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 hDV103S1A0JD37 113 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 F8W1H4 67 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC32Q9BV29 185 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 GGACTQ9BVM4 153 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 NBASA2RRP1 2371 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 RYR2Q92736 4967 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 ROS1P08922 2347 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-212ENST00000491302 GKN2Q86XP6 184 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 Q8TAT8 98 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 LAMA1P25391 3075 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TGP01266 2768 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 VWFP04275 2813 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TLN2Q9Y4G6 2542 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 E7EQ34 232 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 COX7CP15954 63 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 MCEEQ96PE7 176 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 OTORQ9NRC9 128 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRFP10586 1907 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 APCP25054 2843 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF236Q9UL36 1845 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 H3BRM9 83 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL5Q86XS5 388 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 CARD19Q96LW7 228 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRE2 83 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 PSG9Q00887 426 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 SPRNQ5BIV9 151 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TET1Q8NFU7 2136 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 HERC2O95714 4834 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 FREM3P0C091 2139 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf67F2Z3F1 127 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 FAM107AO95990 144 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 IFNA21P01568 189 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 BCL2P10415 239 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.16□□□□□ -2.06
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND6P03923 174 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 SMR3AQ99954 134 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 CENPEQ02224 2701 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 BSNQ9UPA5 3926 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-212ENST00000491302 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms