RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE1Q13065 139 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE4Q13068 117 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE5Q13069 117 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GAGE13Q4V321 117 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q6ZSN1 163 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF575Q86XF7 245 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XKRY2A2RUG3 117 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 P01737 135 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR5AL1P0C617 328 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NFE4Q86UQ8 179 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TPPP3Q9BW30 176 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CRYGDP07320 174 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LELP1Q5T871 98 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PKD1P98161 4303 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SNAI2O43623 268 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLV2-8P01709 118 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM17P0DL12 118 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SSTP61278 116 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF56Q15929 161 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AP1S3Q96PC3 154 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A087WWC5 75 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM250H0YL14 139 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GZMBP10144 247 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CEBPGP53567 150 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RAB4BP61018 213 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 F5H697 171 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LINC00694P0DN24 101 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TOR2AQ5JU69 321 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 F2Z2F3 143 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EREGO14944 169 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CACNG7P62955 275 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q9UF83 564 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C16orf90A8MZG2 172 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-30P01768 117 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-33P01772 117 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGLC6P0CF74 106 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERVFC1-1P60608 527 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OCC1Q8TAD7 63 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NUDT11Q96G61 164 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM210AQ96ND0 272 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 K7EN84 100 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSCAO43653 123 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MGPP08493 103 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRGC1P0CF51 173 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBE2D3P61077 147 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UBE2D2P62837 147 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 Q9HAA7 133 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H7C1H1 209 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LAGE3Q14657 143 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A087WX48 190 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF727A8MUV8 499 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTRLP40313 264 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TWIST1Q15672 202 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WDR73Q6P4I2 378 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TEX261Q6UWH6 196 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms