RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 M0R2P5 195 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CSN2P05814 226 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CCKP06307 115 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R2P41236 205 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 FADDQ13158 208 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RHOHQ15669 191 aa-0.9□□□□□ -2.55
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SENP6-210ENST00000487548 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MTORP42345 2549 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 USP54Q70EL1 1684 aa-0.91□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.91□□□□□ -2.55
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SENP6-210ENST00000487548 ATG12O94817 140 aa-0.91□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.91□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 ZNF609O15014 1411 aa-0.91□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-0.91□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.91□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.92□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.92□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 LYSTQ99698 3801 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.92□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 USF3Q68DE3 2245 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TRIOO75962 3097 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 G3V318 75 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 I3L2K1 104 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 IFNA6P05013 189 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 SMIM6P0DI80 62 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 C4orf33Q8N1A6 199 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 V9GYV3 84 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 ACACAQ13085 2346 aa-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.93□□□□□ -2.566e-8■■□□□ 12.2
SENP6-210ENST00000487548 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 SLIT1O75093 1534 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 ADGRB1O14514 1584 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 DNAJC13O75165 2243 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.94□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 H0YJX3 145 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 IFNA21P01568 189 aa-0.94□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 ARF6P62330 175 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
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SENP6-210ENST00000487548 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 CROCCP2Q86T23 111 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 MED11Q9P086 117 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.94□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.95□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.95□□□□□ -2.56
SENP6-210ENST00000487548 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.95□□□□□ -2.56
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