RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 PRAC2D3DTV9 90 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ERASQ7Z444 233 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 PCP2Q8IVA1 136 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 RNF182Q8N6D2 247 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 NRACQ8N912 160 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 GLMPQ8WWB7 406 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 TM2D2Q9BX73 214 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 LGALS9O00182 355 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 GCSHP23434 173 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ASIPP42127 132 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF575Q86XF7 245 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01006Q8NI28 216 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 JMJD8Q96S16 334 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 INAFM1C9JVW0 142 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 H7C1H1 209 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 CEND1Q8N111 149 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 MDFIQ99750 246 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 F8VRH5 84 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 CRLF1O75462 422 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 FXYD7P58549 80 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 TM4SF20Q53R12 229 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WW49 117 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 OR11H12B2RN74 326 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 H3BVH4 76 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 J3QR89 54 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 SOCS3O14543 225 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PROK1P58294 105 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 OR11H1Q8NG94 326 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 OR11H2Q8NH07 326 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 TOMM6Q96B49 74 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 G3V4G9 280 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 RAB37Q96AX2 223 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 NXPH4O95158 308 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 FXYD2P54710 66 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 FHL3Q13643 280 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 CSTL1Q9H114 145 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 F8W1H4 67 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 J3QL48 77 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 GAS8-AS1O95177 125 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 CD28P10747 220 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 EDN2P20800 178 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 HERVK_113P61574 105 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H4GQ99525 98 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 CUBNO60494 3623 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GWB2 263 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 E9PLD3 99 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 ID1P41134 155 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 SYNJ2BPP57105 145 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 TCTAP57738 103 aa7.16□□□□□ -1.26
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