RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, human

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX13-208	ENST00000482558	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	CSTL1	Q9H114	145 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ACACB	O00763	2458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49	3e-18	■■■■■ 36
SNX13-208	ENST00000482558	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ASIP	P42127	132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558		Q6ZN92	141 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	AKAP6	Q13023	2319 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV3-11	P01762	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TSPO	P30536	169 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TAL2	Q16559	108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558		Q8N8P6	123 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558		M0R381	172 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TRBV12-3	P01733	135 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	FCER1G	P30273	86 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TFPI2	P48307	235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558		Q8N2B8	174 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	RNF185	Q96GF1	192 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	TACC2	O95359	2948 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	KLLN	B2CW77	178 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	NPY	P01303	97 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	RNF224	P0DH78	156 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IGLL1	P15814	213 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	GAGE5	Q13069	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	GAGE6	Q13070	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1B0GV90	55 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	DLEU1	O43261	78 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	NXPH4	O95158	308 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	DCANP1	Q8TF63	244 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	RELN	P78509	3460 aa		5.71	□□□□□ -1.49
SNX13-208	ENST00000482558	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	TCAP	O15273	167 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	SMIM17	P0DL12	118 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	COX8A	P10176	69 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF702P	Q9H963	129 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	SPG11	Q96JI7	2443 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558		A0A096LNJ9	63 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SNX13-208	ENST00000482558	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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