RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 ELOBQ15370 118 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 C12orf74Q32Q52 190 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 CRYGDP07320 174 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 MT-ND6P03923 174 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 EVI2AP22794 236 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 RAB4BP61018 213 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 H7C1H1 209 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 HLA-DQA1P01909 254 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 CAMPP49913 170 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 SSTP61278 116 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 ZNF479Q96JC4 524 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 FAM210BQ96KR6 192 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 YPEL4Q96NS1 127 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-208ENST00000481211 A0A087WWL8 130 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-53P01767 116 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 FHL2Q14192 279 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZTC4 211 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 JPT2Q9H910 190 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PRO0255Q9UI72 69 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TENM3Q9P273 2699 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 H3BNG1 76 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PPP1R17O96001 155 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 LINC00315P59091 139 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 ZNF56Q15929 161 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 MRAP2Q96G30 205 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 F5H697 171 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 F5H768 121 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PPBPP02775 128 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 MGPP08493 103 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 RHOHQ15669 191 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 K7EQD1 137 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 RAB4AP20338 218 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 NUPR2A6NF83 97 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 HOXA5P20719 270 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 CRYBA4P53673 196 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 AMN1Q8IY45 258 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 RNF185Q96GF1 192 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 NACAE9PAV3 2078 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 COLCA2A8K830 154 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 M0QY20 66 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PAX4O43316 350 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 SCO1O75880 301 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 HTN3P15516 51 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TCTAP57738 103 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.16□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 PHOX2AO14813 284 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 APCSP02743 223 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 ORMDL3Q8N138 153 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 NIT2Q9NQR4 276 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
NISCH-208ENST00000481211 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 RAB5AP20339 215 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 CKS2P33552 79 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZSN1 163 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-208ENST00000481211 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.7 ms