RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 TRBV12-3P01733 135 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 HERVK_113P61574 105 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 GAGE13Q4V321 117 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 ZNF815PA8K554 130 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 GNRH2O43555 120 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 SPRY2O43597 315 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 MED13LQ71F56 2210 aa6.56□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 H3BMG7 143 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-11P01762 117 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 WFDC2Q14508 124 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 LINC01620Q4KN68 170 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 IGHG2P01859 326 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 SIGMAR1Q99720 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.55□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 F6UB75 175 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 NXPH4O95158 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 DEFB1P60022 68 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 LY6EQ16553 131 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 A0A087WW49 117 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 RNF223E7ERA6 249 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 VCYO14598 125 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 TMEM141Q96I45 108 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 KIR2DL4Q99706 377 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 AGRNO00468 2067 aa6.54□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 AMTNQ6UX39 209 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 F5H697 171 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 H3BUX3 64 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-39P01824 125 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 PMVKQ15126 192 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 ETDBQ3ZM63 59 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PKP4-210ENST00000480171 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 A6NDX4 124 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 KLLNB2CW77 178 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 K7EMT4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TIMM17AQ99595 171 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 C11orf86A6NJI1 115 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CD7P09564 240 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 COX6B1P14854 86 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 AZU1P20160 251 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LINC00315P59091 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 MTURNQ8N3F0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 IGIPA6NJ69 53 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CRYGDP07320 174 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 UBE2D1P51668 147 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SYT8Q8NBV8 401 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 IGLV1-40P01703 118 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SRD5A1P18405 259 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 PRO0461Q9UI25 63 aa6.51□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SPATA25Q9BR10 227 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 VPS13CQ709C8 3753 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LGALS9O00182 355 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 APOMO95445 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TSHBP01222 138 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 BLCAPP62952 87 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.5□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CACNA1AO00555 2505 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 A0A0J9YY99 117 aa6.49□□□□□ -1.37
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