RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 IL36BQ9NZH7 164 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 ALG5Q9Y673 324 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WX48 190 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PANO1I0J062 215 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 ENHOQ6UWT2 76 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 SYT8Q8NBV8 401 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RMI2Q96E14 147 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.26□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TMEM262E9PQX1 116 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 SFRP2Q96HF1 295 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 COX11Q9Y6N1 276 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PRE2 83 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 USP17L23D6RBM5 183 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RHODO00212 210 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 OXTP01178 125 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DQA1P01909 254 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 UBE2D3P61077 147 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 SSTP61278 116 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 UBE2D2P62837 147 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 MPV17L2Q567V2 206 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 AQP10Q96PS8 301 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 LRP2P98164 4655 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 FAM74A7A6NL05 159 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 MBP02144 154 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PRSS1P07477 247 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TNXBP22105 4242 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 DEFA1P59665 94 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 SERF2P84101 59 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 DNLZQ5SXM8 178 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 A6NHS1 94 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 PTTG1O95997 202 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 CRPP02741 224 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 MT1HL1P0DM35 61 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 GAGE6Q13070 117 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ELOBQ15370 118 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ZNF56Q15929 161 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 LINC01559Q495D7 138 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ZFP82Q8N141 532 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GV50 99 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 SEC11BP0C7V7 166 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 FHITP49789 147 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 UBE2G1P62253 170 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 Q0VG73 95 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ODF1Q14990 250 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 CST9LP1Q5W188 147 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 MED28Q9H204 178 aa7.19□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 LTAP01374 205 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 RBX1P62877 108 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 C14orf177Q52M58 125 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 PRR27Q6MZM9 219 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 FMC1Q96HJ9 113 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-209ENST00000473257 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.17□□□□□ -1.26
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