RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PEMTQ9UBM1 199 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MAST4O15021 2626 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CCL24O00175 119 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LY6G6DO95868 133 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 HBDP02042 147 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CRYGDP07320 174 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IGLL1P15814 213 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FCER1GP30273 86 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TSPOP30536 169 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN1BP46527 198 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TFPI2P48307 235 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-3P60369 221 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 DEFA6Q01524 100 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IL17DQ8TAD2 202 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 DPF1Q92782 380 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SMR3AQ99954 134 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf78Q9BR46 151 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ZMAT4Q9H898 229 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ST20Q9HBF5 79 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MDFICQ9P1T7 246 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ATRQ13535 2644 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C46A6NHA9 309 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 KNCNA6PVL3 124 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 J3KRW8 73 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 K7EMI3 77 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV1-51P01701 117 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FOSL1P15407 271 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB131AP59861 70 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SSTP61278 116 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB2A2Q13296 93 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF124Q15973 351 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA45Q537H7 98 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ATOH7Q8N100 152 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N1Y9 231 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 AP1S3Q96PC3 154 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 JPT2Q9H910 190 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 GHRHP01286 108 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FGF6P10767 208 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ODF1Q14990 250 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 JMJD8Q96S16 334 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 hDV102S1A0JD36 115 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 M0QY20 66 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3-20P01619 116 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CD7P09564 240 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FXYD7P58549 80 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LAGE3Q14657 143 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 F8P00451 2351 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.1□□□□□ -1.75
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