RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A087WWL8 130 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PFDN1O60925 122 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MLST8Q9BVC4 326 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R381 172 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SFRP2Q96HF1 295 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DERL1Q9BUN8 251 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EP13 123 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q9HAA7 133 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP10-1P60331 282 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAGE2Q86Y30 109 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SYT8Q8NBV8 401 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNG13Q9P2W3 67 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RHODO00212 210 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR27Q6MZM9 219 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZFP82Q8N141 532 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C11orf52Q96A22 123 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EREGO14944 169 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV2-8P01709 118 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SULT1A2P50226 295 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WFDC2Q14508 124 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZNX1 250 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N1X5 172 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SVIPQ8NHG7 77 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MANBALQ9NQG1 85 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNAI2O43623 268 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXCL1P09341 107 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XGP55808 180 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CENPWQ5EE01 88 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAT1Q14517 4588 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB19A4D1S5 217 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PSCAO43653 123 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C1QBP02746 253 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A6NJY4 79 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GZMBP10144 247 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB5CP51148 216 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2D3P61077 147 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSTP61278 116 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2D2P62837 147 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR5AL1P0C617 328 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HAMPP81172 84 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LAGE3Q14657 143 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF56Q15929 161 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NIT1Q86X76 327 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A087WWC5 75 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC51BQ86UW2 128 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N814 137 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLC6P0CF74 106 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCL2P10415 239 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCSHP23434 173 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB4BP61018 213 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LECT2O14960 151 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GNG4P50150 75 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MED9Q9NWA0 146 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KLK12Q9UKR0 248 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE6DO43924 150 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKAP14Q86UN6 197 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TPPP3Q9BW30 176 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms