RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 WDR73Q6P4I2 378 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SVBPQ8N300 66 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 PRO0255Q9UI72 69 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 V9GYV3 84 aa7.58□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 A0A1B0GUT8 65 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 HIGD1CA8MV81 97 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 PAX4O43316 350 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 APOC3P02656 99 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CTRLP40313 264 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RIGQ13278 110 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RHEBQ15382 184 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RNF212Q495C1 297 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.57□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0J9YY99 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 F5H697 171 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 NUDT3O95989 172 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 MGPP08493 103 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 ADCYAP1P18509 176 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 NTF3P20783 257 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RHOHQ15669 191 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF479Q96JC4 524 aa7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 A0A087WWL8 130 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 A0A1B0GW15 77 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 H7C1H1 209 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 NXPH4O95158 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CASC10Q5T4H9 136 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 GTSF1Q8WW33 167 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 TENM3Q9P273 2699 aa7.55□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 COL7A1Q02388 2944 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 H3BNG1 76 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SRIP30626 198 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.54□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 K7EQD1 137 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 HOXA5P20719 270 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CRYBA4P53673 196 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 RAB4BP61018 213 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 FHL2Q14192 279 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 NUP35Q8NFH5 326 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 BTF3L4Q96K17 158 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 IMMP2LQ96T52 175 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 CNFNQ9BYD5 112 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 TGP01266 2768 aa7.53□□□□□ -1.2
SAR1B-202ENST00000439578 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 A0A087WWC5 75 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 GYPEP15421 78 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 CCL18P55774 89 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 HBBP68871 147 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 JPT2Q9H910 190 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.52□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 P0DMU3 169 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 FAM231AP0DMU4 169 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 FAM231CP0DMU5 169 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 CAMPP49913 170 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF575Q86XF7 245 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.51□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 CRYGDP07320 174 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 EVI2AP22794 236 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.5□□□□□ -1.21
SAR1B-202ENST00000439578 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms