RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CCR2P41597 374 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KISS1Q15726 138 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2T2Q6IF00 324 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ATOH7Q8N100 152 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNAPQ8N1N2 210 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNRGQ8N5I3 272 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4C16Q8NGL9 310 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 YPEL2Q96QA6 119 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IMMP2LQ96T52 175 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 BANF2Q9H503 90 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.7□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TLCD2A6NGC4 264 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf86A6NJI1 115 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BT86 120 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 GNRH2O43555 120 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SFT2D2O95562 160 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGC2P03986 189 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGC1P0CF51 173 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLC2P0DOY2 106 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLC3P0DOY3 106 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 BCL2P10415 239 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IFITM1P13164 125 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SNCAP37840 140 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 Q0VG73 95 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MSRB3Q8IXL7 192 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM191AQ9H0A3 160 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 OSTCQ9NRP0 149 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 PDZD2O15018 2839 aa2.69□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 COL4A2P08572 1712 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRK2Q5S007 2527 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0D9SEW6 157 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 C7orf77A4D0Y5 90 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 HMSDA8MTL9 139 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 GABARAPH6UMI1 98 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 M0R378 163 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1-16P04430 117 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A6P12236 298 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-12P60413 245 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 PLGLB1Q02325 96 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RTL8BQ17RB0 113 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 STAG3L4Q8TBR4 150 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 DCANP1Q8TF63 244 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MUCL1Q96DR8 90 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 DPH3Q96FX2 82 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 AP1S3Q96PC3 154 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RERGLQ9H628 205 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 V9GYH0 126 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 F5P12259 2224 aa2.68□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM262E9PQX1 116 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 HYPMO75409 117 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 HRES1P13985 223 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 CD52P31358 61 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 INSL3P51460 131 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00315P59091 139 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXF1Q12946 379 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 VMA21Q3ZAQ7 101 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRNQ5BIV9 151 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR15Q8IV56 129 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.67□□□□□ -1.98
CBX1P4-201ENST00000439415 PFN4Q8NHR9 129 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms