RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 NFE4Q86UQ8 179 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WTM6 91 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 LELP1Q5T871 98 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 PRR27Q6MZM9 219 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 SYT8Q8NBV8 401 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 DERL1Q9BUN8 251 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 Q9HAA7 133 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 BAGE2Q86Y30 109 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 SFRP2Q96HF1 295 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 GNG13Q9P2W3 67 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 MLST8Q9BVC4 326 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 K7EP13 123 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 EREGO14944 169 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 ZFP82Q8N141 532 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 RHODO00212 210 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SSTP61278 116 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 MANBALQ9NQG1 85 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 FAT1Q14517 4588 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 PSCAO43653 123 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SULT1A2P50226 295 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SLC51BQ86UW2 128 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 RAB19A4D1S5 217 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-1P60331 282 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 CENPWQ5EE01 88 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 C11orf52Q96A22 123 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.25□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SNAI2O43623 268 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 IGLV2-8P01709 118 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 GZMBP10144 247 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 ZNF56Q15929 161 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.24□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 CXCL1P09341 107 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 RAB5CP51148 216 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 WFDC2Q14508 124 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 Q8N1X5 172 aa9.23□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 HAMPP81172 84 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 TPPP3Q9BW30 176 aa9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PRAME-209ENST00000439106 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 LECT2O14960 151 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 BCL2P10415 239 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 UBE2D3P61077 147 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 UBE2D2P62837 147 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 NIT1Q86X76 327 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 MED9Q9NWA0 146 aa9.21□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TEX46H3BTG2 121 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IFNA1P01562 189 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 OR5AL1P0C617 328 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 GNG4P50150 75 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 XGP55808 180 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IFITM2Q01629 132 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 LAGE3Q14657 143 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 Q8N814 137 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.2□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WWC5 75 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 F5H697 171 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 IGLC6P0CF74 106 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 GCSHP23434 173 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 RAB4BP61018 213 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 KLK12Q9UKR0 248 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 PDE6DO43924 150 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 MGPP08493 103 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 TEX261Q6UWH6 196 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-209ENST00000439106 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.18□□□□□ -0.94
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