RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 PRAC2D3DTV9 90 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 K7EIM0 57 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 PLCE1Q9P212 2302 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.23□□□□□ -0.61
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PTPRU-204ENST00000428026 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.22□□□□□ -0.61
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PTPRU-204ENST00000428026 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-204ENST00000428026 C11orf86A6NJI1 115 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-204ENST00000428026 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa11.2□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-204ENST00000428026 E9PLD3 99 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-204ENST00000428026 C2orf70A6NJV1 201 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 IGLV2-14P01704 120 aa11.18□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.18□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-204ENST00000428026 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.17□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 TCL1BO95988 128 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 Q8N1Y9 231 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRU-204ENST00000428026 ESM1Q9NQ30 184 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 K7EQD1 137 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 H3BUA1 57 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.14□□□□□ -0.63
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PTPRU-204ENST00000428026 BLCAPP62952 87 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZUT4 128 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 GYPEP15421 78 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 Q6ZSR3 168 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 NPBQ8NG41 125 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF503Q96F45 646 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRU-204ENST00000428026 NREPQ16612 68 aa11.13□□□□□ -0.63
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