RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNTFR	P26992	372 aa		7.95	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.95	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		7.95	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACACB	O00763	2458 aa		7.95	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LHB	P01229	141 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLEC2B	Q92478	149 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00477	Q96M19	166 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCL13	Q99616	98 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSHB	P01222	138 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACYP1	P07311	99 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		7.94	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBE2E1	P51965	193 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLRB1	Q12918	225 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAD	P27708	2225 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRBA	P50851	2863 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JPT2	Q9H910	190 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658		J3QLI3	93 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM258	P61165	79 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		7.93	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF152	Q8N8N0	203 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GAFA1	Q96PS6	74 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV3-15	P01624	115 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCL3L1	P16619	93 aa		7.92	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RHOH	Q15669	191 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LST1	O00453	97 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRY3	O43610	288 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GATA4	P43694	442 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLX1	P56177	255 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658		S4R3C0	116 aa		7.91	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAC2	D3DTV9	90 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATOX1	O00244	68 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COX6C	P09669	75 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CXCL5	P42830	114 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZSV7	163 aa		7.9	□□□□□ -1.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.9	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658		K7EIM0	57 aa		7.9	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRYGB	P07316	175 aa		7.9	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		7.9	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCANP1	Q8TF63	244 aa		7.89	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLX6	P56179	175 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRO0628	Q9UI54	55 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRSS2	P07478	247 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAL	P21145	153 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKAP6	Q13023	2319 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658		I3L3M4	83 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		7.88	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF7	Q9UBF6	113 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CACNA1B	Q00975	2339 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPE	Q02224	2701 aa		7.87	□□□□□ -1.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LEPROT	O15243	131 aa		7.87	□□□□□ -1.15

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