RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421722.5

PMS1-208, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2

Gene PMS1, Length 2,285 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-208	ENST00000421722	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	NMES1	Q9C002	83 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		P01737	135 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		Q9UF83	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		K7EQM0	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		Q6ZRP5	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	GCG	P01275	180 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	IFNA7	P01567	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		H7C1H1	209 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TMBIM6	P55061	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	IL15RA	Q13261	267 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		V9GYH0	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SLPI	P03973	132 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	RAB4B	P61018	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	RBX1	P62877	108 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	JPT2	Q9H910	190 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722		A0A087WWL8	130 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	PTTG1	O95997	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	STPG4	Q8N801	248 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	CENPX	A8MT69	81 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	TCRA	P04437	139 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	GNG5	P63218	68 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	RAB32	Q13637	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PMS1-208	ENST00000421722	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	COX6A2	Q02221	97 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	REG3A	Q06141	175 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722		B4DEV8	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	S100A5	P33763	92 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	NHLH2	Q02577	135 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	LPA	P08519	4548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722		A0A1B0GUV1	79 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722		H3BVH4	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	BTC	P35070	178 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PMS1-208	ENST00000421722	GAGE6	Q13070	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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