RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.62□□□□□ -0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYSTQ99698 3801 aa10.62□□□□□ -0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EQD1 137 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRIP30626 198 aa10.61□□□□□ -0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNG7P62955 275 aa10.61□□□□□ -0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.59□□□□□ -0.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JPT2Q9H910 190 aa10.59□□□□□ -0.71
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.58□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPPP3Q9BW30 176 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNFNQ9BYD5 112 aa10.58□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WWL8 130 aa10.57□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.57□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRGC1P0CF51 173 aa10.56□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM17P0DL12 118 aa10.56□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB4BP61018 213 aa10.56□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.56□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYZL1Q6UWQ5 148 aa10.56□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISOC2Q96AB3 205 aa10.56□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.56□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADIRFQ15847 76 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UQCC3Q6UW78 93 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZSN1 163 aa10.54□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTSF1Q8WW33 167 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9H8V8 135 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NTF3P20783 257 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.53□□□□□ -0.72
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF56Q15929 161 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC32Q5I0X7 151 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZR54 194 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BORCS7Q96B45 105 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 V9GYV3 84 aa10.52□□□□□ -0.73
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE4Q13068 117 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE5Q13069 117 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TWIST1Q15672 202 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAGE13Q4V321 117 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GTSF1LQ9H1H1 148 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.51□□□□□ -0.73
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIGD1CA8MV81 97 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F5H697 171 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H7C1H1 209 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EP13 123 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIVA1O15304 175 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WWC5 75 aa10.49□□□□□ -0.73
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