RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396205.6

LMO3-205, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 3,534 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-205ENST00000396205 PRR9Q5T870 116 aa4.6□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.6□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 SIGMAR1Q99720 223 aa4.6□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 A0A1B0GW15 77 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 GPX1P07203 203 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 C9orf85Q96MD7 179 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 ORM1P02763 201 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 SULT1A2P50226 295 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 PKD1P98161 4303 aa4.59□□□□□ -1.67
LMO3-205ENST00000396205 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 HERV-K104P63124 156 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 MRAP2Q96G30 205 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 FMC1Q96HJ9 113 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 EPDR1Q9UM22 224 aa4.59□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TRGC2P03986 189 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 ERCC8Q13216 396 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 ZNF726P1Q15940 193 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 C5orf47Q569G3 176 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 BLNKQ8WV28 456 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 LINC00694P0DN24 101 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 ESDP10768 282 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 FRZBQ92765 325 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 GGTLC3B5MD39 225 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 M0R2P5 195 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PRO0255Q9UI72 69 aa4.58□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PGPA6NDG6 321 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PDE6DO43924 150 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 CCL18P55774 89 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 KIR3DS1Q14943 382 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TVP23CQ96ET8 276 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 BTF3L4Q96K17 158 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 RTL8CO15255 209 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 RS1O15537 224 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 NXPH4O95158 308 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 FHL2Q14192 279 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 VAMP3Q15836 100 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.57□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 LTAP01374 205 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 C11orf52Q96A22 123 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 BATFQ16520 125 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 LINC01559Q495D7 138 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 Q86TA4 180 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 VAMP8Q9BV40 100 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PSG8Q9UQ74 426 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 A0A096LPF7 62 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 GAGE12BA1L429 117 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 H3BTX0 84 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 TYMSP04818 313 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 STPG4Q8N801 248 aa4.56□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 Q6ZTI0 123 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 MANBALQ9NQG1 85 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 IL36BQ9NZH7 164 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 PEX7O00628 323 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 C9JCJ5 164 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 F5H768 121 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 MLST8Q9BVC4 326 aa4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.54□□□□□ -1.68
LMO3-205ENST00000396205 C9JQL5 133 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms