RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 TAS2R41P59536 307 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CDC42P60953 191 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 UBE2KP61086 200 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CAV1Q03135 178 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 GUK1Q16774 197 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 S100A7AQ86SG5 101 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SYS1Q8N2H4 156 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 OR4K15Q8NH41 348 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 AGR3Q8TD06 166 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CDKL2Q92772 493 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM141Q96I45 108 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 HYLS1Q96M11 299 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM210AQ96ND0 272 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 HIST1H2BLQ99880 126 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PRADC1Q9BSG0 188 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM126AQ9H061 195 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 RGCCQ9H4X1 137 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 COMMD9Q9P000 198 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ODF2LQ9ULJ1 636 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ERGIC3Q9Y282 383 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ARL5AQ9Y689 179 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 V9GYY9 64 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 EVC2Q86UK5 1308 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SPTBP11277 2137 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MYH6P13533 1939 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A087WVE0 104 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM159BA6NKW6 160 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 F8WEM9 126 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 H0YCG3 227 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 K7EPI3 171 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 NPFFO15130 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 LYRM1O43325 122 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 NEMFO60524 1076 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 OR2J2O76002 312 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SNX4O95219 450 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CXCL2P19875 107 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CXCL3P19876 107 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 DDTP30046 118 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 S100A3P33764 101 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PHBP35232 272 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PSMD7P51665 324 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 OR10A3P58181 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ERVS71-1P61550 626 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 VSNL1P62760 191 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 UBE2D2P62837 147 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 PRLHP81277 87 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 FABP9Q0Z7S8 132 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 KLRD1Q13241 179 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 NEDD8Q15843 81 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CCDC184Q52MB2 194 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXO48Q5FWF7 155 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SPOPLQ6IQ16 392 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 LYPD5Q6UWN5 251 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 C5orf46Q6UWT4 87 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 UBL4BQ8N7F7 174 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 JOSD2Q8TAC2 188 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 STOML3Q8TAV4 291 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 MGARPQ8TDB4 240 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 TOMM6Q96B49 74 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 RASD2Q96D21 266 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 SMIM12Q96EX1 92 aa-0.69□□□□□ -2.52
SNORD49B-201ENST00000365172 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms