RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GNRH2O43555 120 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 SFTA3P0C7M3 94 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CRIP1P50238 77 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CEBPGP53567 150 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBA4P53673 196 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 FHL2Q14192 279 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF479Q96JC4 524 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf85Q96MD7 179 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 DERL1Q9BUN8 251 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 PARLQ9H300 379 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SGMS1-201ENST00000361543 RAB19A4D1S5 217 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF727A8MUV8 499 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 F2Z2F3 143 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 NXPH4O95158 308 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AL1P0C617 328 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CLLU1Q5K131 121 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.27□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 H3BVH4 76 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 K7EQD1 137 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SIVA1O15304 175 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 GYPEP15421 78 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SRIP30626 198 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CACNG7P62955 275 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CT83Q5H943 113 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF575Q86XF7 245 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.26□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 A8MWL6 223 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RS1O15537 224 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SNAI2O43623 268 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-8P01709 118 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM17P0DL12 118 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ERVFC1-1P60608 527 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RHOHQ15669 191 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 WDR73Q6P4I2 378 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 UQCC3Q6UW78 93 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 AP1S3Q96PC3 154 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.25□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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SGMS1-201ENST00000361543 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 FAM231BA6NCW3 169 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 M0R381 172 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00315P59091 139 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ODF1Q14990 250 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01551Q86U37 167 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 OCC1Q8TAD7 63 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 BORCS7Q96B45 105 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.24□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.23□□□□□ -1.57
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SGMS1-201ENST00000361543 C16orf90A8MZG2 172 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 C9JQL5 133 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TRGC1P0CF51 173 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
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SGMS1-201ENST00000361543 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT11Q96G61 164 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 SFRP2Q96HF1 295 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TPPP3Q9BW30 176 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 OSTCQ9NRP0 149 aa5.23□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 H7C1H1 209 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 K7EN84 100 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R2P9O14990 202 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 IGLC6P0CF74 106 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 CTRLP40313 264 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 ADIRFQ15847 76 aa5.22□□□□□ -1.57
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
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