RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 STHQ8IWL8 128 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 JPT2Q9H910 190 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 A0A096LNJ9 63 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 NBL1P41271 181 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 PCSK5Q92824 1860 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 RASL10AQ92737 203 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-53P01767 116 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YXV3 536 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 H3BUA1 57 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 CFC1BP0CG36 223 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 CFC1P0CG37 223 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 EBI3Q14213 229 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 A4D1N5 150 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PTH2Q96A98 100 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 FOXI1Q12951 378 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RHOHQ15669 191 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 C20orf173Q96LM9 149 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZQT7 251 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 NRACQ8N912 160 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 H3BMM0 161 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 SCGB1A1P11684 91 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2WQ96B02 151 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-59P01825 116 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 LMO4P61968 165 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TEN1Q86WV5 123 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 Q8N1Y9 231 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 Q8N6K4 173 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 CNFNQ9BYD5 112 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 XCL2Q9UBD3 114 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 MED14OSP0DP75 135 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 DSCR9P59020 149 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 LEPROTO15243 131 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 INSP01308 110 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 TIMM17AQ99595 171 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 F8W735 103 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 MDFICQ9P1T7 246 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 RHODO00212 210 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 PRR9Q5T870 116 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRU-201ENST00000345512 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 IGHG2P01859 326 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00158P58513 81 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 PTPRBP23467 1997 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 GATA3P23771 443 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 PIFOQ8TCI5 191 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 RNF223E7ERA6 249 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CDSNQ15517 529 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CARD19Q96LW7 228 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 NOTCH2Q04721 2471 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 TCL1BO95988 128 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB136Q30KP8 78 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRU-201ENST00000345512 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.2 ms