RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 TCAPO15273 167 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 FCER1GP30273 86 aa13.09□□□□□ -0.31
ACTB-201ENST00000331789 PF4P02776 101 aa13.08□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 LINC01587Q99440 93 aa13.08□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 XCL2Q9UBD3 114 aa13.08□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 INSP01308 110 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 PMCHL2Q9BQD1 86 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C20orf202A1L168 122 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 F5H697 171 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 ZNF876PQ49A33 203 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 WFDC10AQ9H1F0 79 aa13.07□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 CRYGDP07320 174 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 DEFA6Q01524 100 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 LAGE3Q14657 143 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C20orf78Q9BR46 151 aa13.06□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 LINC01545Q5VT33 79 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C18orf15Q96N68 181 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C14orf144Q96I85 54 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.05□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.04□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R17O96001 155 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 ZNF415Q09FC8 603 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.03□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 hDV102S1A0JD36 115 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 IGLL1P15814 213 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 ZNF56Q15929 161 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 CSTL1Q9H114 145 aa13.02□□□□□ -0.32
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 AZU1P20160 251 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 TMEM208Q9BTX3 173 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 ST20Q9HBF5 79 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 M0R2P5 195 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 NUDT3O95989 172 aa13.01□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.01□□□□□ -0.33
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ACTB-201ENST00000331789 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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ACTB-201ENST00000331789 M0QY20 66 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 IGLC3P0DOY3 106 aa13□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 F8P00451 2351 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 NACAE9PAV3 2078 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 LGALS9CQ6DKI2 356 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.99□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.98□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 CITED1Q99966 193 aa12.98□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.98□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 PTH2Q96A98 100 aa12.97□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 PRSS1P07477 247 aa12.96□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 SPXQ9BT56 116 aa12.96□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 DKK2Q9UBU2 259 aa12.96□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.96□□□□□ -0.33
ACTB-201ENST00000331789 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.96□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.96□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 K7EMI3 77 aa12.96□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.96□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 A8MWV9 139 aa12.95□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 HSBP1L1C9JCN9 74 aa12.95□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 VCYO14598 125 aa12.95□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 ATP5LO75964 103 aa12.95□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TOMM6Q96B49 74 aa12.95□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.94□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 P0DMU3 169 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 FAM231AP0DMU4 169 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 FAM231CP0DMU5 169 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 CTAG1AP78358 180 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 ODF1Q14990 250 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZN92 141 aa12.93□□□□□ -0.34
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