RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 K7EIM0 57 aa13.19□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 CCL3L1P16619 93 aa13.19□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 IGIPA6NJ69 53 aa13.19□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 MED13Q9UHV7 2174 aa13.18□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 PRAC2D3DTV9 90 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 LEPROTO15243 131 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 Q6ZSV7 163 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.17□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 I3L3M4 83 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 SPRY3O43610 288 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 PEMTQ9UBM1 199 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.16□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF876PQ49A33 203 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 CCL8P80075 99 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.15□□□□□ -0.3
GLIS1-201ENST00000312233 SERP2Q8N6R1 65 aa13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 RNF7Q9UBF6 113 aa13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 S4R3C0 116 aa13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 A0A0J9YXY3 114 aa13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 PFN2P35080 140 aa13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 A0A0J9YX75 114 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 PRSS2P07478 247 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 Q6ZT83 130 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM141Q96I45 108 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 LITAFQ99732 161 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 DKK4Q9UBT3 224 aa13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 MGAQ8IWI9 3026 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 SEC61GP60059 68 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 LINC00311Q8N616 119 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 GFRALQ6UXV0 394 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.11□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 LY6LH3BQJ8 138 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 TIMM17AQ99595 171 aa13.1□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 M0R381 172 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 IGLV1-44P01699 117 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 GPHB5Q86YW7 130 aa13.09□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 EDN2P20800 178 aa13.08□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 RNF182Q8N6D2 247 aa13.08□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF580Q9UK33 172 aa13.08□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 CADP27708 2225 aa13.08□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 PIEZO1Q92508 2521 aa13.08□□□□□ -0.31
GLIS1-201ENST00000312233 APC2O95996 2303 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 KALRNO60229 2985 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 MGPP08493 103 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 KLRB1Q12918 225 aa13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM86BQ8N661 226 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.07□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ZZEF1O43149 2961 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 TIRAPP58753 221 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 DAND5Q8N907 189 aa13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.05□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 RS1O15537 224 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 C9orf85Q96MD7 179 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ATMQ13315 3056 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 ACACAQ13085 2346 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 SYNJ2BPP57105 145 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 FHL2Q14192 279 aa13.04□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R17O96001 155 aa13.03□□□□□ -0.32
GLIS1-201ENST00000312233 NPC2P61916 151 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms