RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SNAI2O43623 268 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNG7P62955 275 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GAS8-AS1O95177 125 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 NUDT3O95989 172 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 EVI2AP22794 236 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ID1P41134 155 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01545Q5VT33 79 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.82□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.81□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFRSF6BO95407 300 aa11.81□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 hDV102S1A0JD36 115 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BVH4 76 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 HBDP02042 147 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 FXYD7P58549 80 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 DCANP1Q8TF63 244 aa11.8□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 GAGE10A6NGK3 116 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC01546A6NGU7 62 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNJ2BPP57105 145 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.79□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 SEC11AP67812 179 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 KIR3DS1Q14943 382 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.78□□□□□ -0.52
TSNARE1-201ENST00000307180 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 ASIPP42127 132 aa11.77□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 ERASQ7Z444 233 aa11.77□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.77□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS9O00182 355 aa11.76□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 GNRH2O43555 120 aa11.76□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 Q8N8P6 123 aa11.76□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.76□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 FCER1GP30273 86 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 LEPP41159 167 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 NRACQ8N912 160 aa11.75□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 KLLNB2CW77 178 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 K7EP34 96 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 M0R381 172 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRY2O43597 315 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 MED14OSP0DP75 135 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 K7EQG2 157 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 MRAP2Q96G30 205 aa11.74□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 C7orf71A4D174 169 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf118A6NHY6 69 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BRM9 83 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF688P0C7X2 276 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMG4Q5JS54 123 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 SIGMAR1Q99720 223 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.73□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.72□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0J9YX75 114 aa11.71□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 C18orf15Q96N68 181 aa11.71□□□□□ -0.53
TSNARE1-201ENST00000307180 AZU1P20160 251 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 ODF3Q96PU9 254 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 PEMTQ9UBM1 199 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.7□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 LAGE3Q14657 143 aa11.69□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV3-20P01619 116 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 COX8AP10176 69 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 AP1S3Q96PC3 154 aa11.68□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 NOTCH1P46531 2555 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 A6NDN8 102 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 NXPH4O95158 308 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP10-11P60412 298 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD52Q0P140 79 aa11.67□□□□□ -0.54
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms