RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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CCNDBP1-201ENST00000300213 M0QXV9 152 aa11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.14□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.14□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TSHBP01222 138 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf173Q96LM9 149 aa11.13□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 OOSP1A8MZH6 123 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01619G3V211 115 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.12□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD28P10747 220 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R17O96001 155 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM101Q96IK0 257 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 B9A039 149 aa11.11□□□□□ -0.63
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