RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD10Q9BYL1 202 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 BATF3Q9NR55 127 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TNXBP22105 4242 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM231BA6NCW3 169 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 GCGP01275 180 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 ENHOQ6UWT2 76 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.99□□□□□ -1.61
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PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD2Q9UBB5 411 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPV4 95 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA7P01567 189 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 P01737 135 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBP04435 133 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TMBIM6P55061 237 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP10-8P60410 259 aa4.98□□□□□ -1.61
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PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP161Q6P656 301 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP6Q8TBB0 222 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 IL36BQ9NZH7 164 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF23A1L1A6 192 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 MPV17L2Q567V2 206 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 VAX2Q9UIW0 290 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WWL8 130 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 PANO1I0J062 215 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CCSO14618 274 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 PTTG1O95997 202 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2D3P61077 147 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2D2P62837 147 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 MAJINQ3KP22 176 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZRP5 223 aa4.96□□□□□ -1.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 PRNTQ86SH4 94 aa4.95□□□□□ -1.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.95□□□□□ -1.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.95□□□□□ -1.62
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PGGT1B-201ENST00000296642 V9GYH0 126 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NHS1 94 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 B4DEV8 164 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BMQ9 156 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BVH4 76 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRAP04437 139 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CHTF8P0CG12 524 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 NHLH2Q02577 135 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 REG3AQ06141 175 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 STPG4Q8N801 248 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SFRP2Q96HF1 295 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 SGK494Q96LW2 274 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R381 172 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB4BP61018 213 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RBX1P62877 108 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG7P62955 275 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG5P63218 68 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 COX6A2Q02221 97 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF56Q15929 161 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 JPT2Q9H910 190 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.92□□□□□ -1.62
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