RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.75□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 F8W036 122 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 OR10J4P0C629 311 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 PYYP10082 97 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 Q8TAT8 98 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 OR51M1Q9H341 326 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 VAX2Q9UIW0 290 aa6.74□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 TMEM250H0YL14 139 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 SNAPINO95295 136 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 CSN1S1P47710 185 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 Q8N3U1 123 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.73□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 A0A087WWC5 75 aa6.72□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 GNRH2O43555 120 aa6.72□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP41-201ENST00000292729 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP41-201ENST00000292729 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP41-201ENST00000292729 NAGKQ9UJ70 344 aa6.72□□□□□ -1.33
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USP41-201ENST00000292729 PDE6DO43924 150 aa6.71□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 TYMSP04818 313 aa6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.7□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 A0A1B0GV50 99 aa6.7□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 C11orf52Q96A22 123 aa6.68□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 GAGE13Q4V321 117 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 PGPA6NDG6 321 aa6.65□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 ZNF727A8MUV8 499 aa6.65□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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USP41-201ENST00000292729 C9orf85Q96MD7 179 aa6.65□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.65□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 PARLQ9H300 379 aa6.65□□□□□ -1.34
USP41-201ENST00000292729 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.64□□□□□ -1.35
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