RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 LINC00315P59091 139 aa8.27□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 TSKUQ8WUA8 353 aa8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 C16orf74Q96GX8 76 aa8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 GPR82Q96P67 336 aa8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 LINC01587Q99440 93 aa8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 C20orf202A1L168 122 aa8.26□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 Q6ZSN1 163 aa8.26□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 BAGE2Q86Y30 109 aa8.26□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 C20orf173Q96LM9 149 aa8.26□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 EPDR1Q9UM22 224 aa8.26□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 A0A0J9YY99 117 aa8.25□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.25□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.24□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 SERF1AO75920 110 aa8.24□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 SCGB1D1O95968 90 aa8.24□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 UBE2G1P62253 170 aa8.24□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.24□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.24□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.24□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.23□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 PMCHP20382 165 aa8.23□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 PDE6HQ13956 83 aa8.23□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 PMCHL1Q16048 86 aa8.23□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.23□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 Q6AWC8 147 aa8.23□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.23□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.22□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 K7EQM0 130 aa8.22□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 SIVA1O15304 175 aa8.22□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.22□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 SYT8Q8NBV8 401 aa8.22□□□□□ -1.09
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SPC25-201ENST00000282074 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SPC25-201ENST00000282074 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.21□□□□□ -1.1
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SPC25-201ENST00000282074 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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SPC25-201ENST00000282074 HBBP68871 147 aa8.21□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 LCE1DQ5T752 114 aa8.21□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.21□□□□□ -1.1
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SPC25-201ENST00000282074 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 NUDT11Q96G61 164 aa8.21□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 VAMP8Q9BV40 100 aa8.21□□□□□ -1.1
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SPC25-201ENST00000282074 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.2□□□□□ -1.1
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SPC25-201ENST00000282074 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.2□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.19□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.19□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 GAGE12BA1L429 117 aa8.19□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 PGPA6NDG6 321 aa8.19□□□□□ -1.1
SPC25-201ENST00000282074 NUPR1O60356 82 aa8.19□□□□□ -1.1
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