RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 IGHG2P01859 326 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 PEMTQ9UBM1 199 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 EDN2P20800 178 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 INSL3P51460 131 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 FXYD2P54710 66 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 NPC2P61916 151 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.58□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 CRYBA4P53673 196 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 LINC01545Q5VT33 79 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 H7C1H1 209 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 LINC01559Q495D7 138 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.57□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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HERC6-201ENST00000264346 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 A0A087WW49 117 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 GATA3P23771 443 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 CD28P10747 220 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 H3BRM9 83 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 VCYO14598 125 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 PF4P02776 101 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 A6NDX4 124 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 A6NJY4 79 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 CFHR3Q02985 330 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 ZNF479Q96JC4 524 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 RBAKDNA6NC62 111 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 PRR9Q5T870 116 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 MRAP2Q96G30 205 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC6-201ENST00000264346 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 C20orf78Q9BR46 151 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 SPXQ9BT56 116 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 MDFICQ9P1T7 246 aa9.53□□□□□ -0.88
HERC6-201ENST00000264346 PLNP26678 52 aa9.53□□□□□ -0.88
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HERC6-201ENST00000264346 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 SPINK8P0C7L1 97 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 UBE2L6O14933 153 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 PTH2Q96A98 100 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 PRM2P04554 102 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 GAGE13Q4V321 117 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 Q8N1Y9 231 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 F8VRH5 84 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 LINC01619G3V211 115 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 KRTAP10-9P60411 292 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ITPR1Q14643 2758 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 C3orf56Q8N813 242 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 GATD1Q8NB37 220 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 TMEM262E9PQX1 116 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 RNF185Q96GF1 192 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 B5MCH6 92 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 H3BUA1 57 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ELANEP08246 267 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 HTN3P15516 51 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ODF1Q14990 250 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC6-201ENST00000264346 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.48□□□□□ -0.89
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