RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 JPT2Q9H910 190 aa11.2□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.2□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 SFTA2Q6UW10 78 aa11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 A0A0J9YY99 117 aa11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.19□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 UBE2D3P61077 147 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 UBE2D2P62837 147 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 FOXI1Q12951 378 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 PMVKQ15126 192 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 PSMB2P49721 201 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 UCNP55089 124 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.18□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 KLLNB2CW77 178 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 IGHV1-69P01742 117 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 HERVK_113P61574 105 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 USMG5Q96IX5 58 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 SRD5A1P18405 259 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 Q6ZS46 218 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 NFE4Q86UQ8 179 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.17□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 A0A087WWL8 130 aa11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 TMEM141Q96I45 108 aa11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 VCYO14598 125 aa11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 LY6EQ16553 131 aa11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.16□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 BRI3O95415 125 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 PF4V1P10720 104 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 EDN2P20800 178 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 TIMM17AQ99595 171 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 KIR2DL4Q99706 377 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 H3BUA1 57 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-30P01768 117 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 IGHG2P01859 326 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.15□□□□□ -0.62
SYP-201ENST00000263233 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 F5H697 171 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 CFC1BP0CG36 223 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 CFC1P0CG37 223 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 ZNF876PQ49A33 203 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 SYT8Q8NBV8 401 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 AMELXQ99217 191 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 CDIP1Q9H305 208 aa11.14□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 PTH2Q96A98 100 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 LRRK2Q5S007 2527 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TENM4Q6N022 2769 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TCL1BO95988 128 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 BLCAPP62952 87 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.13□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GV72 72 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 LGALS9O00182 355 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 IGHV4-39P01824 125 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 FHL3Q13643 280 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 DCANP1Q8TF63 244 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.12□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 H3BUX3 64 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 CARD19Q96LW7 228 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 A6NDX4 124 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 J3QQQ9 107 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 IGLV1-40P01703 118 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 SPG11Q96JI7 2443 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 GNLYP22749 145 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 ID1P41134 155 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 C9orf85Q96MD7 179 aa11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 FBN2P35556 2912 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 C19orf84I3L1E1 186 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 TEN1Q86WV5 123 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 MDFICQ9P1T7 246 aa11.09□□□□□ -0.63
SYP-201ENST00000263233 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms