RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa15.24■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 C16orf92Q96LL3 132 aa15.24■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 ATP5G2Q06055 141 aa15.23■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 C20orf78Q9BR46 151 aa15.23■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 ACANP16112 2415 aa15.23■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 PRR9Q5T870 116 aa15.23■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 M0R381 172 aa15.22■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 DUX5Q96PT3 197 aa15.22■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.22■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 RASL10AQ92737 203 aa15.22■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 CUBNO60494 3623 aa15.21■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.21■□□□□ 0.03
VGF-201ENST00000249330 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 A6NJY4 79 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 Q6YL49 198 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 PRADC1Q9BSG0 188 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 U3KQE9 123 aa15.21■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 J3KRW8 73 aa15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 TRBV12-3P01733 135 aa15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 IGHV3-11P01762 117 aa15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 PF4V1P10720 104 aa15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.2■□□□□ 0.02
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VGF-201ENST00000249330 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 ZNF815PA8K554 130 aa15.19■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.19■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.19■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 APOMO95445 188 aa15.19■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 AKAP9Q99996 3911 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 MGPP08493 103 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 INSL3P51460 131 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 FAM223BA6NKX1 122 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 ASIPP42127 132 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.18■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.17■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 C20orf173Q96LM9 149 aa15.17■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 SPRY2O43597 315 aa15.17■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 LINC00477Q96M19 166 aa15.17■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.16■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 LINC01549A6NIU2 74 aa15.15■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 IGLV1-40P01703 118 aa15.15■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.15■□□□□ 0.02
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VGF-201ENST00000249330 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15.15■□□□□ 0.02
VGF-201ENST00000249330 CFHR3Q02985 330 aa15.15■□□□□ 0.02
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VGF-201ENST00000249330 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 CFAP126Q5VTH2 177 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 NOTCH2Q04721 2471 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 PPP1R17O96001 155 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 CKS1BP61024 79 aa15.14■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 OVOL1O14753 267 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 UBE2D1P51668 147 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 FOXI1Q12951 378 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 ARL17AQ8IVW1 177 aa15.13■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 MED14OSP0DP75 135 aa15.12■□□□□ 0.01
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VGF-201ENST00000249330 TSPAN13O95857 204 aa15.12■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 USMG5Q96IX5 58 aa15.12■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 H3BUA1 57 aa15.11■□□□□ 0.01
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VGF-201ENST00000249330 HERVK_113P61574 105 aa15.11■□□□□ 0.01
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VGF-201ENST00000249330 ZNF702PQ9H963 129 aa15.1■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 PSMB8P28062 276 aa15.09■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.09■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 SYT8Q8NBV8 401 aa15.09■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.09■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 NF1P21359 2839 aa15.08■□□□□ 0.01
VGF-201ENST00000249330 GPHB5Q86YW7 130 aa15.08■□□□□ 0
VGF-201ENST00000249330 C11orf86A6NJI1 115 aa15.08■□□□□ 0
VGF-201ENST00000249330 UBE2D3P61077 147 aa15.08■□□□□ 0
VGF-201ENST00000249330 UBE2D2P62837 147 aa15.08■□□□□ 0
VGF-201ENST00000249330 GNRH2O43555 120 aa15.07■□□□□ 0
VGF-201ENST00000249330 CRYGDP07320 174 aa15.07■□□□□ 0
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