RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 FLNCQ14315 2725 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 TAX1BP3O14907 124 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 CACNG7P62955 275 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 MBD6Q96DN6 1003 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 FOXC2Q99958 501 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 PRSS1P07477 247 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 FXYD7P58549 80 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.17□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 KLK15Q9H2R5 256 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 ZFHX3Q15911 3703 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 IGLL1P15814 213 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 HERVK_113P61574 105 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 FOXE3Q13461 319 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 SMPXQ9UHP9 88 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.16□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 LEPP41159 167 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 F8W735 103 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 PSCAO43653 123 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 ERG28Q9UKR5 140 aa8.15□□□□□ -1.1
PRRX1-201ENST00000239461 H3BRM9 83 aa8.15□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 GTSF1Q8WW33 167 aa8.15□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 H7C2G1 150 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 K7EMT4 169 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM126AQ9H061 195 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 A0A096LNT2 108 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PPM0 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 M0R381 172 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 CCL24O00175 119 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 IGHG4P01861 327 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 AVPP01185 164 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 PIFOQ8TCI5 191 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM160Q9NX00 188 aa8.14□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 D6R8Y8 96 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 DEFB131AP59861 70 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 A8MWV9 139 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV2-11P01706 119 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 SEC61GP60059 68 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 GPHB5Q86YW7 130 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 F8W1H4 67 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TRBV12-3P01733 135 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 Q6YL49 198 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 XCL2Q9UBD3 114 aa8.13□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM213A2RRL7 107 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 H3BMG7 143 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 AMN1Q8IY45 258 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 PPP1R17O96001 155 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GXF2 115 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 PRAC2D3DTV9 90 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 BRI3O95415 125 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 CR1P17927 2039 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01619G3V211 115 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV3-53P01767 116 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.12□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 WFDC2Q14508 124 aa8.11□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 AMTNQ6UX39 209 aa8.11□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 RCHY1Q96PM5 261 aa8.11□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.11□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 NUPR1O60356 82 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01559Q495D7 138 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM86BQ8N661 226 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 IGLV1-40P01703 118 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 CD7P09564 240 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.1□□□□□ -1.11
PRRX1-201ENST00000239461 HBDP02042 147 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms