RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 CD3EP07766 207 aa15.57■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.57■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 CRYGDP07320 174 aa15.57■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa15.57■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 KIR2DL4Q99706 377 aa15.57■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 Q6ZS46 218 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 VMO1Q7Z5L0 202 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 MED13LQ71F56 2210 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 Q8N9W7 124 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 LINC01560Q8TB33 94 aa15.56■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 C11orf86A6NJI1 115 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 DEFB1P60022 68 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 TEN1Q86WV5 123 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 MGPP08493 103 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 PRTN3P24158 256 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 PPDPFLQ8WWR9 84 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 RNF183Q96D59 192 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 C20orf173Q96LM9 149 aa15.55■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 A0A0J9YY99 117 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 TSHBP01222 138 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 PRORYQ9H606 182 aa15.54■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 ATP6V0E1O15342 81 aa15.53■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 G3V318 75 aa15.53■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PMS1-222ENST00000639501 M0R1W7 72 aa15.52■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 CFC1BP0CG36 223 aa15.52■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 CFC1P0CG37 223 aa15.52■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.52■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.52■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 KLRB1Q12918 225 aa15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 LY6DQ14210 128 aa15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 EBI3Q14213 229 aa15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.51■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ERG28Q9UKR5 140 aa15.5■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.5■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 GPHB5Q86YW7 130 aa15.5■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 C16orf92Q96LL3 132 aa15.5■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 METTL26Q96S19 204 aa15.5■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 USP24Q9UPU5 2620 aa15.49■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-30P01768 117 aa15.49■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.49■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.49■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 MUC4Q99102 2169 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 A8MWV9 139 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.48■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ZNF688P0C7X2 276 aa15.47■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 U3KQE9 123 aa15.47■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 GNRH2O43555 120 aa15.46■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.46■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.46■□□□□ 0.07
PMS1-222ENST00000639501 ASIPP42127 132 aa15.46■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 LYRM7Q5U5X0 104 aa15.45■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.45■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 IGIPA6NJ69 53 aa15.45■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 AMELXQ99217 191 aa15.45■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 ARL3P36405 182 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 ZNRF2Q8NHG8 242 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.44■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 SLC25A29Q8N8R3 303 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 RAX2Q96IS3 184 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 ANAPC13Q9BS18 74 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 SS18L2Q9UHA2 77 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 F6UB75 175 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 JPT2Q9H910 190 aa15.43■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 HERVK_113P61574 105 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 TIMD4Q96H15 378 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 LINC00315P59091 139 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 KLK9Q2XQG4 91 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 AJUBAQ96IF1 538 aa15.42■□□□□ 0.06
PMS1-222ENST00000639501 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms