RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	NPY	P01303	97 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	EDN2	P20800	178 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	CACNG7	P62955	275 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	GPHB5	Q86YW7	130 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		H3BRM9	83 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	CNFN	Q9BYD5	112 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	ORM1	P02763	201 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SMKR1	H3BMG3	65 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	CRLF1	O75462	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		A6NDN8	102 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	C9orf118	A6NHY6	69 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		K7ERU9	68 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SNAI2	O43623	268 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	CD28	P10747	220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	HSD52	Q0P140	79 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPIN3-208	ENST00000638481		K7EMT4	169 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	NDUFA7	O95182	113 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	VPS25	Q9BRG1	176 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SLURP1	P55000	103 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	GAGE10	A6NGK3	116 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	FCER1G	P30273	86 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	FXYD7	P58549	80 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	ERCC8	Q13216	396 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1W2PRX2	142 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC01619	G3V211	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481		K7EP34	96 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	LGALS9	O00182	355 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFRSF6B	O95407	300 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	PROK1	P58294	105 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	LEP	P41159	167 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	MAST4	O15021	2626 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	NMU	P48645	174 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SORL1	Q92673	2214 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481		Q8N8P6	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPIN3-208	ENST00000638481	SOCS3	O14543	225 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP5L	O75964	103 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	ATR	Q13535	2644 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	ODF1	Q14990	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	HIGD1B	Q9P298	99 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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