RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 TXNDC17Q9BRA2 123 aa12.63□□□□□ -0.39
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CLN3-241ENST00000635861 K7EP13 123 aa12.62□□□□□ -0.39
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CLN3-241ENST00000635861 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
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CLN3-241ENST00000635861 LY96Q9Y6Y9 160 aa12.57□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.56□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 SRIP30626 198 aa12.56□□□□□ -0.4
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CLN3-241ENST00000635861 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.56□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.56□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 A0A1W2PPV4 95 aa12.55□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 ZNF727A8MUV8 499 aa12.55□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 K7EQD1 137 aa12.55□□□□□ -0.4
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CLN3-241ENST00000635861 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
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CLN3-241ENST00000635861 STAG3L2P0CL84 134 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 STAG3L3P0CL85 134 aa12.54□□□□□ -0.4
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CLN3-241ENST00000635861 PQLC2Q6ZP29 291 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.54□□□□□ -0.4
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CLN3-241ENST00000635861 PDE6DO43924 150 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 EVI2AP22794 236 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 ZNF479Q96JC4 524 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 IMMP2LQ96T52 175 aa12.54□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 NDUFA6P56556 154 aa12.53□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.53□□□□□ -0.4
CLN3-241ENST00000635861 TRAV21A0A0B4J279 112 aa12.52□□□□□ -0.41
CLN3-241ENST00000635861 A0A1B0GV50 99 aa12.52□□□□□ -0.41
CLN3-241ENST00000635861 F6UZH7 168 aa12.52□□□□□ -0.41
CLN3-241ENST00000635861 M0R2P5 195 aa12.52□□□□□ -0.41
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