RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TAAR5O14804 337 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM75Q8N9X5 138 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WWC5 75 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 GCGP01275 180 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T35Q8NGX2 323 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC11BP0C7V7 166 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC30Q96LL9 226 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PARLQ9H300 379 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK12Q9UKR0 248 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPV4 95 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YIZ8 118 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PQLC2Q6ZP29 291 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PTH2Q96A98 100 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM3Q9BZL3 60 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00694P0DN24 101 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP69Q49AA0 526 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2WQ96B02 151 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MWV9 139 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP2Q6ZN57 461 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD10Q9BYL1 202 aa17.84■□□□□ 0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A4P26447 101 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EQM0 130 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SMUG1Q53HV7 270 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNIP4Q6PIL6 250 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 NIT1Q86X76 327 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 Q9UF83 564 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG8Q9UQ74 426 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB11Q9Y547 144 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WX48 190 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV2-11P01706 119 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 CYCSP99999 105 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 MZT2BQ6NZ67 158 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRAP04437 139 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB2AP61019 212 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOBQ15370 118 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf177Q52M58 125 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PRNTQ86SH4 94 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf17Q8NAS9 161 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 JPT2Q9H910 190 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00479Q96M42 142 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRTA1Q5VZB9 504 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL14EPLP0DKL9 152 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ASIPP42127 132 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC32Q9BV29 185 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL12P30050 165 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10G9Q8NGN4 311 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10G7Q8NGN6 311 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2G3Q8NGZ4 309 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf43Q9BWL3 253 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM74A4Q5TZK3 123 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PET100P0DJ07 73 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 Q0VG73 95 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CHCHD7Q9BUK0 85 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RHODO00212 210 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 UFSP1Q6NVU6 142 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ENKURQ8TC29 256 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CRPP02741 224 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC1Q9HC57 220 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM262E9PQX1 116 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BVH4 76 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ATRAIDQ6UW56 229 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MPC2O95563 127 aa17.69■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 H2BFSP57053 126 aa17.69■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 EPDR1Q9UM22 224 aa17.69■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DQA1P01909 254 aa17.68■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 GCHFRP30047 84 aa17.68■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 IL36BQ9NZH7 164 aa17.68■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WWL8 130 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 B4DEV8 164 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L23D6RBM5 183 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 STAG3L2P0CL84 134 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 STAG3L3P0CL85 134 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf54Q8N8G6 183 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11H4Q8NGC9 324 aa17.67■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP5P3A8MUU1 101 aa17.66■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV34A0A0B4J273 112 aa17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1HL1P0DM35 61 aa17.64■□□□□ 0.41
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