RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 RNF212Q495C1 297 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 CT83Q5H943 113 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 DNLZQ5SXM8 178 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf85Q96MD7 179 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 DKK2Q9UBU2 259 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 CELA1Q9UNI1 258 aa6.09□□□□□ -1.43
SGMS1-211ENST00000626236 V9GYV3 84 aa6.09□□□□□ -1.43
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SGMS1-211ENST00000626236 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CXorf65A6NEN9 183 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 LYRM9A8MSI8 78 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 A8MWL6 223 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R2P9O14990 202 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SPINK4O60575 86 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 MT-ND4LP03901 98 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.08□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 DEFB130AP0DP74 79 aa6.08□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZTI0 123 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SPXQ9BT56 116 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 IL36BQ9NZH7 164 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.08□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 MUC4Q99102 2169 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPQ1 181 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE12BA1L429 117 aa6.07□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 GAGE7O76087 117 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 IGLC6P0CF74 106 aa6.07□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 MED14OSP0DP75 135 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 DAD1P61803 113 aa6.07□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 SVBPQ8N300 66 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 TSKUQ8WUA8 353 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 GTSF1Q8WW33 167 aa6.07□□□□□ -1.44
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SGMS1-211ENST00000626236 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.07□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 TGP01266 2768 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SNAI2O43623 268 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SNAPINO95295 136 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AL1P0C617 328 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 RHEBQ15382 184 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf74Q32Q52 190 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF876PQ49A33 203 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP82Q8N141 532 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SYT8Q8NBV8 401 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.06□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 FAM231BA6NCW3 169 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 HIGD1CA8MV81 97 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 F2Z2F3 143 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CTRLP40313 264 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CACNG7P62955 275 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N3U1 123 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 RASL10AQ92737 203 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 BORCS7Q96B45 105 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087WWC5 75 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NXPH4O95158 308 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-53P01767 116 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 TWIST1Q15672 202 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZTC4 211 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NUP35Q8NFH5 326 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 PTH2Q96A98 100 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NACAE9PAV3 2078 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 RS1O15537 224 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 HTN3P15516 51 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NTF3P20783 257 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 WDR73Q6P4I2 378 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.03□□□□□ -1.44
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