RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768		M0R3E3	92 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	BCL2L11	O43521	198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SSNA1	O43805	119 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	NXPH4	O95158	308 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ATP5G1	P05496	136 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ID1	P41134	155 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ATP5G3	P48201	142 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	MEOX2	P50222	304 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HBG1	P69891	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HBG2	P69892	147 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PSG9	Q00887	426 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	FGL1	Q08830	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR5I1	Q13606	314 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PSG3	Q16557	428 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZQT7	251 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	STX12	Q86Y82	276 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	GPR82	Q96P67	336 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ATP5S	Q99766	215 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LECT2	O14960	151 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	MPDU1	O75352	247 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HBE1	P02100	147 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR10J4	P0C629	311 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ERCC8	Q13216	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V1F	Q16864	119 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PRR9	Q5T870	116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768		Q8NBF4	154 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	NEB	P20929	6669 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF253	O75346	499 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RLN2	P04090	185 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	CXCL2	P19875	107 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RAB2A	P61019	212 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PFDN5	Q99471	154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	MED28	Q9H204	178 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	INS	P01308	110 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RAB31	Q13636	194 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZRG5	221 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768		Q8TAT8	98 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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