RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 DSCR8Q96T75 97 aa15.66■□□□□ 0.1
CTDP1-208ENST00000613122 SPRY2O43597 315 aa15.66■□□□□ 0.1
CTDP1-208ENST00000613122 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZSR3 168 aa15.66■□□□□ 0.1
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CTDP1-208ENST00000613122 IGKV1-17P01599 117 aa15.66■□□□□ 0.1
CTDP1-208ENST00000613122 SPANXA1Q9NS26 97 aa15.66■□□□□ 0.1
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CTDP1-208ENST00000613122 ESM1Q9NQ30 184 aa15.65■□□□□ 0.1
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CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.65■□□□□ 0.1
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CTDP1-208ENST00000613122 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CTDP1-208ENST00000613122 INSL3P51460 131 aa15.63■□□□□ 0.09
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CTDP1-208ENST00000613122 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.62■□□□□ 0.09
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CTDP1-208ENST00000613122 TECTAO75443 2155 aa15.57■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 IL17DQ8TAD2 202 aa15.57■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 UTF1Q5T230 341 aa15.56■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 COX11Q9Y6N1 276 aa15.56■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 NCKAP5O14513 1909 aa15.56■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 MSMPQ1L6U9 139 aa15.55■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 IGHG4P01861 327 aa15.55■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa15.55■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.55■□□□□ 0.08
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CTDP1-208ENST00000613122 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
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CTDP1-208ENST00000613122 hADV29S1A0JD25 119 aa15.54■□□□□ 0.08
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CTDP1-208ENST00000613122 IGLL5B9A064 214 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 PRAC2D3DTV9 90 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 MED13Q9UHV7 2174 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 PRO3102Q9H379 93 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 LMO4P61968 165 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFS5O43920 106 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-208ENST00000613122 EML6Q6ZMW3 1958 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-208ENST00000613122 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-208ENST00000613122 MED13LQ71F56 2210 aa15.51■□□□□ 0.07
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